Predicción de rendimiento de híbridos de jitomate con huellas genómicas

Abstract

En México, el jitomate es la especie hortícola más importante, pero no existe producción de semilla ni variedades propias. El Instituto de Horticultura de la Universidad Autónoma Chapingo, ha desarrollado 92 líneas avanzadas, que podrían producir 4,186 cruzas simples, cantidad imposible e incosteable de probar experimentalmente. De febrero de 2010 a agosto de 2011 se desarrolló una investigación para predecir el rendimiento de híbridos de jitomate con base en la evaluación de los de una muestra. Se caracterizó las 92 líneas con 17 marcadores moleculares ISSR, que generaron 116 bandas (92 % polimórficas). Con el coeficiente de Jaccard y el método de la varianza mínima de Ward, se asignaron los genotipos a cuatro grupos heteróticos. Se eligieron dos grupos (X y Y) para predecir el rendimiento, con 5 y 8 líneas de X y Y, respectivamente, se generaron 40 cruzas simples y se evaluó su rendimiento de fruto por planta. Se diseñó un programa en IML de SAS para predecir el rendimiento de cruzas no realizadas con el método del mejor predictor lineal e insesgado o BLUP. El método se validó con 100 y 1000 conjuntos de n=5, 10, 15, 20, 25, 30 y 35 híbridos predictores tomados al azar y se predijo el rendimiento de las 40-n cruzas no observadas. Los coeficientes de correlación entre rendimientos observados y predichos fluctuaron entre 0.446 y 0.778. Los resultados sugieren que la predicción del rendimiento de híbridos en jitomate es posible con el BLUP, que relaciona información fenotípica y genotípica.