Variabilidad genética de Hemileia vastatrix (Berk. & Br.) en zonas cafetaleras del Estado de Veracruz, México

Abstract

México es uno de los principales países productores de café a nivel mundial, el valor total de la producción se estima en 4,996 millones de pesos, de los cuales el 72.6 % se destina al pago de jornales, respecto al valor de las exportaciones se han estimado en más de 351 mdd durante el 2018. Los estados que concentran la mayor producción son Chiapas, Veracruz, Puebla y Oaxaca. El principal problema fitosanitario de este cultivo es la roya del café, ocasionado por el hongo Hemileia vastatrix, el cual tiene como hospedante al género Coffea. En México existe poca información acerca de la variabilidad genética en las poblaciones del hongo, por lo que el objetivo de este trabajo fue determinar a nivel genético las posibles variaciones del patógeno en el estado de Veracruz, así como el uso de enzimas de restricción para diferenciar visualmente entre cada población. Mediante la comparación de secuencias se realizó un árbol filogenético y un análisis de haplotipos, así como el uso de enzimas de restricción, con lo cual, los resultados obtenidos mostraron diversidad genética entre las poblaciones, esto se podría deber a la presencia de las variedades de café (tolerantes y susceptibles) establecidas en los patosistemas. En los sistemas cafetaleros a nivel mundial se conocen más de 50 razas fisiológicas de H. vastatrix, en México solo se ha reportado la especialización de la raza II, sin embargo los resultados indican la presencia de nuevas razas. La digestión de los fragmentos ITSs con enzimas de restricción no permitió evidenciar diferencias visuales entre las poblaciones del patógeno, sin embargo los análisis previos si mostraron variabilidad, lo que podría deberse a los sitios de corte específicos a los que las enzimas reconocen en la región ITS, los cuales no se observaron en los geles de agarosa.