Transcriptómica comparativa durante el desarrollo de frutos de Opuntia albicarpa Scheinvar y Opuntia joconostle F.A.C. Weber

Abstract

El nopal es un cultivo de importancia histórica, económica y social en México, el cual tiene gran potencial por las propiedades que presenta. Perteneciente a la familia Cactaceae, el género Opuntia cuenta con aproximadamente 180 especies reportadas, 80 de las cuales están presentes en México. Diversas especies de Opuntia se cultivan esencialmente para el consumo de sus frutos y cladodios tiernos (nopalitos), además de múltiples usos como: forraje, medicina natural, biogás, tintes, cosméticos, biopolímeros, entre otros. El objetivo de la presente investigación fue obtener el transcriptoma de frutos en desarrollo de Opuntia albicarpa y Opuntia joconostle para conocer los cambios fisiológicos que ocurren durante el proceso de maduración. Para O. albicarpa el total de lecturas obtenido fue alrededor de 704 millones y un ensamble de 240,169 transcritos; mientras que para O. joconostle se obtuvieron alrededor de 573 millones de lecturas y un ensamble de 159,783 transcritos. Se detectaron cerca de 39,000 y 33,000 secuencias de proteínas con BlastP para O. albicarpa y O. joconostle, respectivamente. En las vías del Metabolismo de carbohidratos de O. albicarpa se detectaron genes cuya expresión fue en aumento (BGLU12, TPPA, TPS7, TPPG, BAM2, PFK6, FBA3, XYLA, AGAL3 y GALM) y genes cuya expresión tendió a la baja (ADG2, PGMP, WAXY, TPS9, SPS, BGLU44, SS1, SS, DPEP, PFK3, GOLS2, AGAL1, RFS, FBA2, CFBP1 y TPI); mientras que para O. joconostle la expresión de los genes del Metabolismo de carbohidratos tendió a la baja (SS, SS4, TPS5, DPE2, AMY3, AGPS1, AAE3, ACO3, MD1, rbcL, SHM7, GDCSP, PPD, PPCA, accD y IPMSA). Los resultados pueden ser utilizados para estudios genéticos y moleculares sobre el género Opuntia y con ello comprender mejor su biología.