MICROBIOTA BACTERIANA FECAL DE ESPECIES DE VERTEBRADOS EN LA RESERVA DE LA BIOSFERA MAPIMÍ

Abstract

"La Reserva de la Biosfera Mapimí (RBM) es un ecosistema representativo del Desierto Chihuahuense. El análisis de microbiomas de poblaciones silvestres ha demostrado que las comunidades bacterianas se encuentran asociadas mediante diversas interacciones entre especies nativas y no nativas. La transmisión inter-especie de bacterias puede por lo tanto afectar la dinámica de dichas poblaciones. De lo anterior se desprende la importancia de la microbiota fecal en la salud de su hospedero, en especial en poblaciones de vertebrados con una alta interacción y diversidad como la observada en la RBM. El objetivo del presente estudio fue analizar la microbiota bacteriana fecal(MBF) de un total de 14 especies de vertebrados: 12 especies de silvestres: vertebrados diurnos (coyote, CO; gato montés, GM; venado bura, VB; liebre cola negra, LC y tortuga del bolsón, TB), vertebrados nocturnos (rata canguro Merriam, DM; rata canguro Nelson, DN; ratón chihuahuense, CC; ratón Nelson, CN; ratón cactus, RC; rata magueyera, RM y murciélago pálido, MP) y dos especies domésticas (bovinos, BO y equinos, EQ). Asimismo, se evaluó lasimilitud y potencial patógeno y/o zoonótico de todas las especies del microbioma de cada vertebrado. Se colectaron muestras fecales (n=45) utilizando técnicas específicas para cada especie. Se extrajo el DNA bacteriano y se amplificó la región V3-V4 del gen 16s rRNA con primers específicos. La secuenciación masiva se realizó en un Miseq de Illumina. Los resultados se analizaron con QIIME utilizando la referencia de EzBioCloud. El phylum Firmicutes estuvo presente en todas las muestras de los vertebrados con una abundancia de 60% del total de todas las secuencias. Se confirmó la presencia de 24 géneros y siete especies bacterianas patógenas y/o zoonóticas en algunas especies de los vertebrados estudiados. El análisis de coordenadas principales (PCoA) usado para comparar la similitud de microbiota bacteriana entre especie de vertebrados, mostró la separación de las especies con base en su composición y tipo de dieta conformando cuatro grupos: roedores nocturnos (DM, DN, CC, CN, RC y RM), carnívoros (CO y GM), herbívoros rumiantes (BO y VB) y un grupo mixto (EQ, LC, TB y MP). Con estainvestigación se muestra por primera vez la estructura de la comunidad microbiana fecal de especies de vertebrados en la RBM. Las diferencias y similitudes registradas obedecen, de manera general, al proceso evolutivo de adaptaciónfisiológica digestiva de estas especies en este hábitat particular. Esta información servirá de base a estudios posteriores que profundicen en el papel que desempeñan las bacterias intestinales en la salud de la fauna silvestre."