Asociaciones entre regiones genómicas y caracteres asociados a tolerancia de tomate (Solanum lycopersicum L.) al estrés hídrico

Abstract

A nivel mundial, una de las principales problemáticas para la producción agrícola es el estrés hídrico. Ésta adquiere mayor relevancia en cultivos como el tomate, cuya importancia económica es alta. El aumento de la sequía en México y la limitada disponibilidad de agua, han derivado en el desarrollo de variedades con mayor tolerancia al déficit hídrico. El objetivo de la presente investigación fue identificar a través de genotipificado por secuenciación y análisis de asociación genómica, asociaciones entre regiones genómicas y factores de tolerancia al estrés hídrico en líneas de tomate durante la etapa de plántula. El estudio fue realizado en el invernadero del Campo Agrícola Experimental de la Universidad Autónoma Chapingo. Se utilizaron 68 líneas homocigóticas de tomate, las cuales fueron sometidas a diferentes condiciones de humedad: riego normal y estrés hídrico. Los caracteres fenotípicos evaluados fueron los relacionados con crecimiento y desarrollo: altura de plántula, longitud de raíz, materia seca y área foliar. Previamente se efectuó la extracción y secuenciación de ADN para identificar SNPs (polimorfismos de nucleótido simple). Finalmente se detectaron 6 SNPs asociados con características relacionadas con la tolerancia al déficit hídrico mediante los análisis GWAS.