Identificación de regiones genómicas asociadas a calidad de fruto y rendimiento en 95 líneas de tomate (Solanum lycopersicum L.)

Abstract

La tecnología de secuenciación de ADN de nueva generación ha llevado al desarrollo de aplicaciones de detección rápida de polimorfismo de nucleótido único (SNP) en todo el genoma en varias especies de plantas para la creación de mapas de asociación (GWAS). El uso de esta técnica ha permitido definir la participación de genes en los cromosomas de caracteres cuantitativos, así como, reducir los ciclos de selección para la creación de nuevas variedades. La comprensión y recopilación de información sobre los avances e impactos del estudio del genoma completo es importante para poder aplicar esta técnica en investigaciones, por tal motivo, primero se copilo información sobre los principios básica de genotipificación y asociación del genoma completo. Posteriormente se llevó acabo la aplicación de las técnicas antes descritas en 95 líneas avanzadas (F10 a F12) del programa de mejoramiento genético de la Universidad Autónoma Chapingo (UACh), producto de cruces entre variedades e híbridos comerciales de tomate para caracteres fenotípicos de calidad y rendimiento del fruto de tomate, generando 88 marcadores se asociaron con 4 variables, número de frutos (NF), peso del fruto del racimo (CW), peso del fruto (FW) y diámetro ecuatorial del fruto (DE).