Diversidad genética para características de importancia económica en bovinos Suizo Europeo
Diversidad genética para características de importancia económica en bovinos Suizo Europeo
Date
2021-12-16
Authors
Trujano Chávez, Mitzilin Zuleica
Journal Title
Journal ISSN
Volume Title
Publisher
Universidad Autónoma Chapingo
Abstract
El objetivo de la presente investigación fue estudiar la diversidad genética de una
población mexicana de bovinos Suizo Europeo para varias características de
importancia económica, mediante parámetros poblacionales como
heterocigosidad observada, coeficiente de consanguinidad y frecuencia de alelos
favorables. Además, se usó estadística multivariada para visualizar la dispersión
de los animales con base en su perfil genotípico (análisis de componentes
principales, escalamiento multidimensional no métrico y agrupación por los
métodos de agrupamiento jerárquico y K-means). Todos los análisis se realizaron
con al menos 150 animales genotipados con el chip Genomic Profile Bovine LD
de 30K y 50K marcadores de polimorfismo de nucleótido simple. En el primer
estudio se encontró que, para muchos de los genes relacionados con calidad de
la carne, la población mexicana de Suizo Europeo presentó alta frecuencia alélica
favorable para genes asociados con mayor suavidad, mayor marmoleo, menor
cantidad de ácidos grasos saturados, y menor fuerza de corte (CAPN1 y DGAT2).
En el segundo estudio se midió la diversidad genética para características
reproductivas, donde los genes CSNK1E, DNAH11, DSC2, IBSP y OCLN
afectaron la mayoría de las características y fueron altamente informativos por lo
que se encontraron al menos dos grupos con potencial de selección. En el tercer
estudio se determinó la diversidad y estructura genética de la misma población
para resistencia y susceptibilidad a mastitis. Si bien, 13.3% de los animales
fueron altamente consanguíneos (>50%), hubo grupos altamente heterocigotos,
indicativo de diversidad y por tanto favorables. Aunque, los genotipos
homocigotos para genes inmunológicos (grupo CXCL) podrían ser favorables
para características como resistencia a mastitis clínica y subclínica. En los tres
estudios se encontró evidencia del potencial genético de la población mexicana
de Suizo Europeo, para mejorar características complejas asociadas con calidad
de la carne, reproducción y mastitis.
Description
Tesis (Maestría en Ciencias en Innovación Ganadera)
Keywords
consanguinidad,
estadística multivariada,
genes candidatos,
SNP