Maestría en Ciencias en Innovación Ganadera
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Entre sus objetivos están: preparar personal especializado en las diferentes áreas de la producción animal para contribuir al avance del conocimiento científico, a la docencia y al proceso de la producción e innovación ganadera; generar y difundir resultados de investigación que permitan explicar problemas concretos de la producción animal, así como formular alternativas de desarrollo en el sector pecuario; y desarrollar tecnologías pertinentes para participar en la resolución de problemas de los productores pecuarios.
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ItemDiversidad genética para características de importancia económica en bovinos suizo Europa(Universidad Autónoma Chapingo, 2021-12)El objetivo de la presente investigación fue estudiar la diversidad genética de una población mexicana de bovinos Suizo Europeo para varias características de importancia económica, mediante parámetros poblacionales como heterocigosidad observada, coeficiente de consanguinidad y frecuencia de alelos favorables. Además, se usó estadística multivariada para visualizar la dispersión de los animales con base en su perfil genotípico (análisis de componentes principales, escalamiento multidimensional no métrico y agrupación por los métodos de agrupamiento jerárquico y K-means). Todos los análisis se realizaron con al menos 150 animales genotipados con el chip Genomic Profile Bovine LD de 30K y 50K marcadores de polimorfismo de nucleótido simple. En el primer estudio se encontró que, para muchos de los genes relacionados con calidad de la carne, la población mexicana de Suizo Europeo presentó alta frecuencia alélica favorable para genes asociados con mayor suavidad, mayor marmoleo, menor cantidad de ácidos grasos saturados, y menor fuerza de corte (CAPN1 y DGAT2). En el segundo estudio se midió la diversidad genética para características reproductivas, donde los genes CSNK1E, DNAH11, DSC2, IBSP y OCLN afectaron la mayoría de las características y fueron altamente informativos por lo que se encontraron al menos dos grupos con potencial de selección. En el tercer estudio se determinó la diversidad y estructura genética de la misma población para resistencia y susceptibilidad a mastitis. Si bien, 13.3% de los animales fueron altamente consanguíneos (>50%), hubo grupos altamente heterocigotos, indicativo de diversidad y por tanto favorables. Aunque, los genotipos homocigotos para genes inmunológicos (grupo CXCL) podrían ser favorables para características como resistencia a mastitis clínica y subclínica. En los tres estudios se encontró evidencia del potencial genético de la población mexicana de Suizo Europeo, para mejorar características complejas asociadas con calidad de la carne, reproducción y mastitis.
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ItemProductividad, emisiones de metano, estado antioxidante y calidad de carne de rumiantes suplementados con taninos: metaanálisis(Universidad Autónoma Chapingo, 2022-01)Los antibióticos se han utilizado como promotores del crecimiento en rumiantes. Sin embargo, la aparición de bacterias resistentes a estos fármacos ha conducido a la búsqueda de productos alternativos con efectos similares a los antibióticos, pero de origen natural. En un primer estudio, se evaluaron los efectos de la suplementación dietética con taninos (TANs) en el comportamiento productivo, la fermentación ruminal y las emisiones de metano (CH4) en bovinos para carne usando metaanálisis (MA). La suplementación con TANs no afectó el comportamiento productivo (p>0.05); sin embargo, mejoró la concentración ruminal de propionato y butirato, y redujo la concentración ruminal de nitrógeno amoniacal y las emisiones de CH4 (p<0.01). En un segundo estudio se evaluaron los efectos de la suplementación dietética de una mezcla poliherbal (MP) en el comportamiento productivo, las características de la canal y la calidad de la carne de corderos. No hubo efectos (p>0.05) de MP en comportamiento productivo, características de canal, color y composición química de la carne. La fuerza de corte disminuyó, mientras que pH y pérdida por goteo de la carne aumentaron linealmente (p<0.05) cuando se incrementó la dosis de MP. En un tercer estudio se evaluaron los efectos de la suplementación dietética con TANs en el comportamiento productivo, calidad de la carne y estado antioxidante del suero sanguíneo de ovinos usando MA. La suplementación con TANs no afectó el consumo de MS ni la calidad de la carne (p>0.05); sin embargo, aumentó la ganancia de peso, la capacidad antioxidante total y redujo la conversión alimenticia (p<0.05). En conclusión, es posible utilizar TANs para reducir emisiones de CH4 en bovinos y mejorar el comportamiento productivo y estado antioxidante en ovinos. Además, la MP podría utilizarse para mejorar la terneza de la carne de ovinos.
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ItemParámetros y tendencias genéticas de variables de crecimiento para bovinos Romosinuano en México(Universidad Autónoma Chapingo, 2018)Se estimaron los parámetros genéticos y tendencias genéticas para características de crecimiento en el ganado Romosinuano que se encuentra en México. La base de datos provino de la Asociación Mexicana de Criadores de Ganado Romosinuano y Criollo Lechero Tropical, A. C. La información utilizada incluyó 895 registros de peso al nacimiento (PN) y 517 de peso al destete (PD). El pedigrí final incluyó 4,537 animales nacidos entre 1950 y 2016. Los análisis fueron realizados mediante el programa ASReml, preliminarmente usando análisis univariados para identificar los mejores modelos, y comparándolos mediante la prueba de razón de verosimilitud. Los análisis finales se realizaron mediante un modelo animal bivariado para ambas características. El modelo final incluyó los efectos fijos de grupo contemporáneo (año-hato-época-sexo) y la covariable edad de la madre al parto, lineal y cuadrática. Los efectos aleatorios fueron los genéticos aditivos directos para ambas características y los genéticos aditivos maternos para el PD, y la interacción semental por grupo contemporáneo para ambas características. Las tendencias genéticas para PN y PD fueron estimadas mediante una regresión lineal simple del promedio de los valores genéticos sobre el año de nacimiento de los animales. Las estimaciones de heredabilidad para efectos directos fueron 0.19 ± 0.09 y 0.21 ± 0.12, para PN y PD. La heredabilidad materna para PD fue 0.04 ± 0.05. La proporción de la varianza fenotípica explicada por la interacción semental por grupo contemporáneo fue 0.21 ± 0.05 y 0.11 ± 0.08 para PN y PD. La correlación genética entre PN y PD fue 0.69. Las tendencias genéticas para PN y PD no fueron diferentes de cero (P>0.05). Las estimaciones de heredabilidad para PN y PD fueron moderadamente bajas, pero con variabilidad genética suficiente para implementar un programa de selección en estas características.
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ItemComparación de valores genéticos utilizando marcadores SNP y modelos uni- y bivariados(Universidad Autónoma Chapingo, 2018)El objetivo fue comparar análisis genómicos univariados vs bivariados para pesos al nacer (PN), al destete (PD) y al año (PA) en bovinos Suizo Europeo. Los criterios de comparación fueron la jerarquización de los valores genómicos predichos (VGn), la habilidad de predicción de los modelos y los coeficientes de regresión de los VGn predichos con una alternativa de análisis sobre los VGn obtenidos con la otra, y viceversa. Los estimadores de heredabilidad genómica directa de PN, PD y PA fueron 0.72, 0.65 y 0.64 para PN, PD y PA, respectivamente; el correspondiente a heredabilidad genómica materna para PD fue 0.21. Los estimadores de los coeficientes de correlación de Pearson y Spearman entre los VGn predichos con análisis univariados y bivariados variaron de 0.845 a 0.994 (p≤0.0001) y de 0.843 a 0.989 (p≤0.0001), respectivamente. Los análisis bivariados tuvieron mejor habilidad predictiva que los univariados; excepto los análisis bivariados de PN con PD y PA. Los estimadores de los coeficientes de correlación Pearson entre VGn provenientes de análisis univariados (VGnU) y los VGn provenientes de análisis bivariados (VGnB), cuando los VGnU fueron las variables independientes, variaron de 0.96±0.06 a 1.37±0.06 (p≤0.0001); mientras que cuando los VGnB lo fueron, variaron de 0.70±0.02 a 0.82±0.01 (p≤0.0001). En conclusión, la jerarquización de los valores genómicos predichos con modelos univariados es similar a la obtenida con modelos bivariados, la habilidad predictiva de los modelos bivariados es mayor que la de los univariados, especialmente para características registradas en el tiempo más cerca la una de la otra, y los VGnU pueden utilizarse para predecir los VGnB y viceversa.
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ItemEvaluación genética de bovinos Suizo Europeo basada en marcadores moleculares(Universidad Autónoma Chapingo, 2018)El objetivo fue comparar las predicciones de valores genéticos (VG) de pesos al nacimiento (PN), al destete (PD) y al año (PA) de bovinos Suizo europeo obtenidas con un modelo animal (PBLUP) utilizando información fenotípica y de pedigrí con las obtenidas con modelos basados en marcadores moleculares: GBLUP (PBLUP+información genómica), GBLUP+A (PBLUP+información genómica y de pedigrí) y RKHS (Reproducing Kernel Hilbert Space). Los criterios para comparar los modelos fueron: magnitud de los estimadores de parámetros genéticos, habilidad de predicción, jerarquización de los VGs predichos y estimadores de los coeficientes de regresión de los VGs predichos con un modelo sobre los obtenidos con otro. Los modelos genómicos rindieron mayores estimadores de los componentes de varianza genética y ambiental para las tres características evaluadas. Mediante validación cruzada se observó mejor habilidad predictiva para los tres modelos que incluyeron información genómica para las tres características estudiadas. La jerarquización y relación de los VGs predichos para PN y PA fue diferente entre BLUP y modelos genómicos, para PD cada uno de los modelos produjo predicciones y jerarquización de los VGs equivalentes a las de los demás. El cambio promedio de las predicciones de los VGs respecto a los fenotipos pre-ajustados fue mayor con PBLUP (1.322) que con GBLUP (1.193), GBLUP+A (1.185) y RKHS (1.205). Lo anterior indica que las predicciones con los modelos basados en marcadores moleculares, mejoraron las estimaciones de los parámetros genéticos, asociaciones de los valores observados y predichos, y redujeron el sesgo de los valores genómicos respecto a los valores fenotípicos pre-ajustados para algunas características de crecimiento comparadas con PBLUP. La implementación de la selección de los mejores animales con base en información genómica podría tener mayor impacto que la selección basada en información fenotípica y de pedigrí en Bovinos Suizo europeo.